Sejak diluncurkan sekitar lima tahun yang lalu, GR Yaris terus mengalami peningkatan. Pada tahun 2025, Toyota memperkenalkan body kit baru yang terdiri dari enam item untuk mobil subkompak ini. Salah satu fitur yang paling mencolok adalah sayap belakang yang dapat disesuaikan untuk keperluan balap. Sayap ini diklaim dapat meningkatkan stabilitas mobil pada kecepatan tinggi dan pengereman keras. Selain itu, pendinginan mesin untuk mesin 1.6 liter tiga silinder turbocharged juga ditingkatkan dengan kap mesin baru yang terbuat dari aluminium. Toyota juga menambahkan saluran udara baru di berbagai bagian mobil untuk meningkatkan stabilitas dan koefisien drag yang lebih rendah.
Paket aero tersebut juga meliputi bibir spoiler depan dan penyamaran baru untuk tangki bahan bakar yang diadaptasi dari mobil balap GR Yaris yang berkompetisi di Super Taikyu Series Jepang. Transmisi otomatis delapan percepatan juga mengalami peningkatan dengan perpindahan gigi yang lebih cepat dan responsif, terutama dalam mode manual. Berbagai perubahan lainnya termasuk baut yang diperlebar, power steering elektrik yang disetel ulang, peredam kejut yang ditingkatkan, dan pijakan kaki yang lebih besar. Harga untuk GR Yaris yang diperbarui bervariasi mulai dari 3.560.000 yen ($24.700) hingga 5.330.000 yen ($37.000) tergantung pada trim dan transmisi yang dipilih. Toyota belum mengonfirmasi apakah model baru ini akan tersedia di luar pasar Jepang.
