Program Makan Bergizi Gratis (MBG) yang dicanangkan oleh Presiden RI Prabowo Subianto di Kabupaten Jayapura, Papua, masih menghadapi kendala dalam pelaksanaannya jika dibandingkan dengan daerah lain di Indonesia. Penjabat Bupati Jayapura, Semuel Siriwa, menjelaskan bahwa program ini baru diuji coba di sejumlah sekolah di wilayah tersebut, terutama untuk jenjang Taman Kanak-kanak (TK) dan Sekolah Dasar (SD), seperti SD Dobonsolo Sentani, SD Kemiri Sentani, SD Angkasa Lanud Silas Papare, dan TK Angkasa Lanud Silas Papare.
Pihak Kabupaten Jayapura masih menunggu petunjuk lebih lanjut terkait pelaksanaan program MBG ini, yang sebagian besar sumber pembiayaannya berasal dari pusat. Penjabat Bupati Siriwa menyatakan bahwa mereka menjalani program ini dengan baik dan menunggu juknis resmi dari pemerintah pusat sebelum melaksanakannya. Kabupaten Jayapura telah ditunjuk sebagai pilot project untuk pemberian Makan Bergizi Gratis bagi anak-anak di Provinsi Papua.
Namun, hingga saat ini, Kabupaten Jayapura belum bisa menerapkan program MBG karena belum mendapatkan petunjuk resmi dari pusat. Semua pembiayaan program ini diperoleh dari pusat, tetapi rincian pembiayaan untuk siapa saja masih belum jelas. Diharapkan agar petunjuk tersebut segera diterima agar Makan Bergizi Gratis dapat segera dilaksanakan di sekolah-sekolah wilayah Papua.